Après avoir séché leurs larmes en souvenir de leurs aînés, qui se sont sacrifiés pour entrouvrir un passage vers Elysion dans le mur des lamentations, nos quatre chevaliers de bronze se mettent en route ... Sentant la présence d’ennemis, Shiryu assure l'arrière garde de ses compagnons. Il se retrouve face à Queen (spectre de la Mandragore), Gordon (spectre du Minotaure) et Sylphide (spectre du Basilic). Seiya, Hyoga et Shun arrivent en bout du tunnel et se retrouvent face une hyper-dimension infranchissable pour de simples mortels. C’est alors que Minos du Griffon réapparait devant eux. Hyoga décide de l'affronter pour permettre à ses deux amis de s'échapper. Alors que les corps de Seiya et Shun dérivent dans l'espace-temps et que tout semble perdu, des ailes se déploient sur l'armure de Pégase. Seiya récupère son ami et emprunte le chemin qui mène à Elysion. S'assurant que ses deux amis sont hors d'atteinte des coups du Juge des Enfers, Hyoga passe à l'offensive en gelant les fils cosmiques du griffon et lui assène sa technique ultime « L’Exécution de l'Aurore ». Retenu par un seul fil au chevalier du Cygne, Minos pénètre lui aussi dans l'hyper dimension. N'étant pas protégé par une armure régénérée par le sang d’un dieu, Minos explose littéralement sans laisser la moindre trace. Après un âpre combat contre les 3 spectres, Shiryu parvient à se défaire de ses assaillants grâce à sa technique ultime héritée de son maître Dohko : « Les 100 Dragons de Rozan ». Grâce aux ailes déployées sur l’armure de Hyoga, les deux derniers chevaliers font désormais route vers Elysion.

Ikki se présente à son tour dans le tunnel creusé dans le mur des lamentations face à l’hyper dimension. Pandore lui propose de traverser en échange de sa vengeance. En effet, étant plus jeune, c'est elle même qui a déclenché le mal en ouvrant la boîte scellée par Athéna, contenant les esprits des Dieux de la Mort et du Sommeil : Thanatos et Hypnos, serviteurs de sa majesté Hadès. Pandore offre son bracelet à Ikki pour lui permettre de rejoindre Elysion. Elle subit instantanément le châtiment divin qui la plonge dans les profondeurs de la mort. A Elysion, Thanatos se présente devant Seiya suivi par son frère jumeau Hypnos. Ce dernier leur apprend qu’Athéna est plongée dans un sommeil éternel, dans une jarre sacrée, qui absorbe peu à peu tout son sang. C’est poussé par l'énergie du désespoir que Seiya parvient à éviter les attaques de Thanatos, cependant, il est très vite dépassé par la puissance de dieu de la Mort. Sur Terre, l'Ultime Éclipse est à son apogée, tandis que Marine ramène Seika, la sœur de Seiya. Revoyant sa sœur disparue, le chevalier Pégase retrouve toute son énergie et renvoie une attaque surpuissante qui balaye Thanatos...

Marine a retrouvé la sœur de Seiya, « Seika », qui vivait en fait juste à côté du Sanctuaire dans le village de Rodorio. Ne supportant pas la séparation avec son petit frère, elle le suivit sans relâche, mais finit par tomber dans un ravin tout proche lors de ses recherches... Par chance un vieil homme la recueillit pour la soigner mais elle perdit la mémoire lors de la chute. Pour punir Seiya qui a osé lever la main sur un Dieu, Thanatos veut un châtiment exemplaire : il torture sa sœur à distance. Un à un, tous les chevaliers présents au Sanctuaire forment une barrière de protection autour de Seika. Ils anticipent les attaques de Thanatos grâce au pouvoir de télékinésie de Kiki. Au moment où le dieu de la Mort est sur le point de porter le coup de grâce au frère et à sa sœur, Shun s’interpose avec sa chaîne nébullaire ... Il est suivi par Shiryu, Hyoga et Ikki. Le combat est très inégal tant la différence de puissance entre les cinq chevaliers de bronze et Thanatos est importante. Alors que tout semble perdu, les armures d'Or du Sagittaire, du Verseau, de la Balance, de la Vierge et du Lion se rapprochent d’Elysion pour envelopper et protéger les corps meurtris de nos cinq héros.

Nos héros ont revêtu les armures d'or animées par l'esprit des chevaliers d'or défunts. Grâce à l’aide de Poséidon, qui a réinvesti un court instant le corps de Julian Solo, elles ont pu traverser la route menant jusqu'à Elysion. Cependant, ils vont vite se rendre compte que malgré leurs habits dorés et la somme de leurs attaques, il en faut bien plus pour ébranler le dieu de la Mort. Thanatos leur assène son attaque : « La terrible Providence » et parvient à détruire les armures d'or pourtant les plus solides parmi les 88 constellations. Cependant, Hypnos s'inquiète du fait que son frère ne soit toujours pas venu à bout des chevaliers de bronze. Remotivé par les voix d’Athéna, de tous ses frères d’armes et de sa sœur, Seiya retrouve ses forces et crie le nom de « Seika » avec l'énergie du désespoir... Brusquement, elle retrouve la mémoire. Seiya élève alors son cosmos jusqu'à son paroxysme et les fragments restants de son armure de bronze viennent se fixer sur son corps... ils s'embrasent pour former l’armure divine de Pégase. Seiya retrouve toutes ses forces et porte un coup fatal au Dieu de la Mort...

Seiya court vers Athéna et laisse Hypnos en découdre avec ses quatre compagnons. Ikki est le premier à se mesurer au Dieu du Sommeil. Au moment où Hypnos est sur le point de s'en prendre au chevalier Phénix, l’armure divine d'Andromède vient recouvrir le corps de Shun qui s’interpose. Préoccupé par le départ de Seiya et Ikki vers le temple d’Hadès, Hypnos veut terminer au plus vite le combat. Il utilise sa technique de « Torpeur éternelle » sur le chevalier Andromède et le plonge dans un sommeil éternel. Ne voulant prendre aucun risque quant à un éventuel réveil de Shun, Hypnos s’apprête à lui porter le coup de grâce ... Le chevalier du Dragon et le chevalier du Cygne entrent en scène pour protéger leur ami. Ils endossent à leur tour leurs habits divins. Seiya arrive enfin au temple d’Hadès et découvre le corps endormi de Saori. La jarre sacrée, gorgée par le sang de la déesse, a pratiquement intégralement changé de couleur. Malgré les coups que Seiya lui inflige, celle-ci reste intacte. L’esprit d’Hadès apparait devant Seiya et lui explique que toutes ses tentatives ne serviront à rien : rien ni personne ne peut briser cette jarre. Grâce à leurs attaques combinées, Shiryu et Hyoga parviennent à se défaire d’Hypnos et réveillent Shun de son sommeil. Ikki rejoint Seiya afin de l'aider à sauver Saori. Grâce au sang répandu autour de la jarre et de la capacité de régénération de son armure, Ikki endosse l'armure divine de Phénix. Voyant qu’ils n'arriveront pas à briser la jarre, Ikki et Seiya se rendent dans le tombeau d’Hadès tout proche, afin de se débarrasser du véritable corps d’Hadès pour qu'il ne puisse plus jamais se réincarner. Au moment de frapper le caveau, l'esprit d’Hadès prend possession de son corps et fait désormais face aux deux chevaliers.

Hadès déplace la jarre contenant Saori jusqu'à lui et déploie son épée afin d’en finir. Les cinq chevaliers réunis font bloc autour de leur déesse. Élevant leur cosmo-énergie, ils attaquent ensemble le dieu des Enfers mais ne parviennent qu’à l’égratigner. Hadès reconnait en Seiya le chevalier qui le pourchasse depuis la nuit des temps. Il décide de le réduire à néant afin qu’il ne puisse plus se réincarner. Sur Terre, l’Ultime Éclipse est désormais complète et la victoire d’Hadès semble inéluctable. Au moment où Hadès va porter le dernier coup au chevalier Pégase, une bulle de protection l’entoure ainsi que tous ses compagnons. Athéna les remercie pour leur devoir accompli et souhaite affronter seule le dieu des Enfers. C’est alors que Seiya remet son armure à Saori. Sortant de sa jarre, elle se présente devant Hadès vêtue de sa Cloth. Elle avoue s’être fait faire prisonnière délibérément par Hypnos afin qu’Hadès se montre en personne et ainsi mettre un terme à cette guerre mythologique. Seiya s’interpose dans le duel des deux Dieux et reçoit le coup d’épée destiné à Athéna.... Petit à petit son cosmos s’affaiblit et finit par disparaitre. Poussés par l’amour qu’ils portent à leur frère d’arme, Athéna, entourée de ses chevaliers passe à l’offensive. La déesse lance son sceptre qui vient transpercer Hadès tel une flèche. Le monde qu’il avait construit disparait avec lui. Sur Terre, le soleil réapparait signant la victoire des chevaliers d’Athéna...